NOUVELLES PEU DIFFUSÉES

Il faut interdire les expériences de « gain de fonction »

Ce bloc-notes apporte des nouvelles scientifiques peu répandues. Son écriture a commencé en 2000 à Hong Kong, bien avant l'existence de ce qu'on appelle aujourd'hui maladroitement « blog » (bloc-notes en est l'équivalent français) avec le séminaire Stanislas Noria. Bien sûr, le savoir présenté ici par Antoine Danchin n'entre pas en compétition avec les nouvelles d'agences de presse comme l'Agence France Presse ou Reuters. Il sélectionne une information (souvent absente des media habituels et, pour la Chine, provenant d'informateurs avertis). Il apporte aussi des connaissances sur l'Histoire des Sciences et la création des concepts utilisés par la biologie moderne, souvent aujourd'hui sous la forme d'une mise à jour de la génomique. Un aspect important de la nature intime de la Science a été discuté au cours d'une conférence donnée à l'Université Zhong Shan (中山大學) de Guangzhou (广州) au début des années 1990. Enfin, le rôle de la Chine est particulièrement mis en avant : le monde occidental est si puissant dans sa façon de contrôler les media que cela semble bien nécessaire. Cependant on notera que, depuis quelques années, un changement politique majeur dans l'ouverture de la Chine au monde ne permet plus d'y avoir un accès fiable à l'information.

Les sources les plus visibles sont supposées accessibles au lecteur. Plusieurs sites donnent des nouvelles à propos de la grippe saisonnière A (H3N2) et de la grippe aviaire (H5N1, H7N7, H9N2). Il existe aussi une carte quotidienne générale des maladies. Parmi les épisodes de grippe possibles qui créeraient des ravages, il y a les épidémies de grippe, notamment liées au sérotype H2, H2N2 en particulier, qui pourraient être beaucoup plus meurtrières. Espérons que, contrairement au SRAS, l'épidémie actuelle aura servi de leçon.

Le bloc-notes de Crawford Kilian s'est désormais étendu à toutes sortes d'autres maladies et surveille la Toile avec soin. Le Center for Infectious Disease Research Policy (CIDRAP) de l'Université du Minnesota, et le site de l'Organisation Mondiale de la Santé (OMS) sont des sources d'information prioritaires. L'information circule aujourd'hui très rapidement, et nous ne donnons donc ici que des compléments. Pour les grippes H7N9, H9N2, H5N1 et désormais surtout H3N8 les données sont accessibles directement à notre page en anglais (lorsqu'il y a lieu d'en parler) et au centre de surveillance de Hong Kong.

Mise à jour continue de l'infection par le 2019-nCoV (via le CCSE de l'Université Johns Hopkins)

Mise à jour quotidienne générale
Analyse de la mortalité

Dans le cas de l'épidémie COVID-19, notez que les chiffres sont donnés à titre purement indicatif et changent rapidement.

Publications à usage du public général

Toutes les nouvelles | Titres seuls

	24 novembre 2023. Début de la première saison hivernale dans l'hémisphère nord après la pandémie du virus SARS-CoV-2. Nos maladies sont façonnées par notre comportement. Animal hautement social, l'homme est condamné à propager des maladies qui suivent les différentes manières dont les contacts entre personnes sont établis. En hiver, nous avons tendance à nous réfugier à l'intérieur et à réduire nos distances sociales. La pandémie de COVID-19 s'est traduite par une diminution des contacts, en particulier grâce à l'utilisation généralisée de masques. Maintenant que toutes ces restrictions ont été levées, nous pouvons nous attendre à une explosion de maladies respiratoires causées par les principaux agents pathogènes viraux et bactériens qui infectent les poumons et les voies respiratoires supérieures. Notre principale préoccupation devrait être de surveiller l'augmentation attendue de la co-infection par différents agents pathogènes, car cela augmenterait considérablement la possibilité de réassort et de recombinaison entre leurs génomes. Cela pourrait conduire à l'émergence d'un nouvel agent pathogène dangereux. À cet égard, le réassort entre les virus de la grippe doit être surveillé de près.
	27 Septembre 2023. Le médicament antiviral que nous avions signalé comme mutagène a influencé l'avolution du virus SARS-CoV-2. L'idée d'utiliser des analogues des briques de base qui forment le corps d'un virus pour en prévenir la multiplication est ancienne. Nous avions remarqué une tentative d'utiliser cette approche fortement médiatisée comme un succès à l'époque pour conduire à un taux d'erreur important au cours de la réplication du génome viral et mis en garde contre le fait que cet effet mutagène pourrait avoir des conséquences néfastes. C'est malheureusement le cas pour le virus lui-même: l'usage du molnupiravir permet au virus d'explorer un paysage évolutif entièrement nouveau. Cela lui ouvre de nouvelles voies d'adaptation qui n'auraient pas été explorées autrement et met en péril notre capacité à contrôler la pandémie.
	28 Juillet 2023. Prestige BioTech, une société enregistrée au Nevada et non autorisée à exercer ses activités en Californie, a laissé des échantillons dangereux sans surveillance. Prestige BioTech a déplacé des biens appartenant à une société en faillite, Universal Meditech Inc. dans un entrepôt du comté de Fresno en Californie. "Certaines pièces de l'entrepôt contenaient plusieurs récipients contenant des liquides et divers appareils", selon les documents du tribunal. "Le personnel de santé publique du comté de Fresno a aussi observé des échantillons de sang, de tissus et d'autres fluides corporels, ainsi que des sérums, et des milliers de flacons de fluides non étiquetés et de probable matériel biologique. Dans l'entrepôt, des centaines de souris étaient captives dans des conditions inhumaines. La ville a pris possession des animaux en avril et a euthanasié 773 d'entre eux ; plus de 175 ont été retrouvés morts. Le centre de contrôle et de prévention des maladies (CDC) a testé les substances et a détecté au moins 20 agents potentiellement infectieux, dont le coronavirus, le VIH, l'hépatite et l'herpès. Cela montre que de graves accidents sont à craindre même dans les endroits où il existe une réglementation sévère contrôlant en principe le matériel biologique.
	17 Juillet 2023. Des milliards de crabes des neiges (Chionoecetes opilio) ont disparu du Détroit de Béring Sans doute à cause des températures record des océans et à la diminution de la formation de glace dans la région arctique, et après une explosion en 2018, une chute massive et inattendue de la population de crabes des neiges a été constatée en 2021. Depuis, les autorités fédérales américaines ont fortement limité les prises autorisées et les pêcheries ont été fermées en 2022. D'autres espèces de crabes disparaissent aussi rapidement. Comme son nom l'indique (χιονι signifie glace en grec), les espèces de ce genre dépendent de la glace et du plancton spécifique à la basse température  qui est source de nourriture pour leurs proies : petits crustacés, mollusques, vers et toutes les formes de vie qui se nourrissent de plancton. Ces crabes sont des organismes psychrophiles qui ne supportent pas les températures supérieures à 5°C environ. Cet effondrement devrait être un signal d'alarme pour suivre la pérennité de la chaîne alimentaire de l'hémisphère nord.
	20 Mai 2023. Une importante résurgence de COVID-19 se développe à Hong Kong Le nombre de cas quotidiens a atteint 10 000 à Hong Kong, mais les autorités sanitaires ont déclaré que l'épidémie était gérable en raison d'un taux de vaccination élevé et d'une maladie moins grave. Vendredi, environ 2 700 patients atteints du virus Covid-19 avaient été hospitalisés, avec une durée moyenne de séjour relativement courte de 4,8 jours.
	16 Avril 2023. Organisée par le Beijing Genome Institute (BGI), la conférence internationale annuelle ICG-18 a débuté le 12 avril et se terminera le 28 avril It is scheduled to be held in various locations notamment à Zhangjiajie, Pékin, Xi'an, Nanjing, Wenzhou, Shanghai, Singapour, Hangzhou et peut-être Londres. Outre l'accent habituel mis sur le projet du génome humain, cette année sera l'occasion de célébrer le 80e anniversaire du livre de Schrödinger Qu'est-ce que la vie ? Cette question sera présentée lors d'une conférence inaugurale le 22 avril à Singapour.
	11 Avril 2023. Des gènes de résistance aux antibiotiques ont été fréquemment trouvés dans des bactéries probiotiques provenant d'aliments et de compléments alimentaires Une étude publiée dans Eurosurveillance montre que le génome d'un nombre considérable de bactéries utilisées comme compléments alimentaires, par exemple dans les yaourts, est contaminé par des groupes de gènes de résistance aux antibiotiques, souvent mobiles. Cette situation est très préoccupante car elle implique que la résistance aux antibiotiques peut se propager par le biais de l'alimentation industrielle. Parmi les espèces probiotiques analysées, Bifidobacterium animalis et Lactococcus lactis montraient la plus forte proportion d'échantillons positifs pour la résistance aux antibiotiques.
	3 Février 2023. Les accidents de laboratoire ou d'usine existent bien Il est important de produire des vaccins faits d'organismes vivants, mais leur confinement est important. Comme les organismes en question sont inoffensifs, voire protecteurs, les accidents ne devraient pas être un sujet d'inquiétude. Cependant, ces accidents permettent de vérifier la plausibilité que cela se produise dans des circonstances beaucoup plus inquiétantes. L'isolement du poliovirus vaccinal WPV3 dans un échantillon d'eaux usées aux Pays-Bas, a conduit à l'identification, l'isolement et la surveillance, ainsi qu'au traçage des contacts d'un employé infecté.
	29 Janvier 2023. Une expérience terrifiante de gain de fonction utilisant la forme du virus H5N1 de la grippe aviaire qui se transmet au vison pourrait être en cours Selon le magazine Science, "Mme Monne indique que son équipe et d'autres étudient actuellement les propriétés du virus du vison et les effets des mutations qu'il a accumulées. Ils veulent notamment étudier le degré de transmission du virus par contact étroit entre animaux. "Nous prévoyons également de faire des études sur la transmission par aérosol", dit-elle." Il semble que certains scientifiques, ainsi que les agences de financement n'aient pas tiré les leçons de l'hybris passé d'enquêteurs irresponsables. Ce type d'expérience ne nous aiderait pas à comprendre quoi que ce soit, sauf si le virus s'échappe du laboratoire et crée ensuite une nouvelle pandémie, bien pire que celle du COVID-19.
	19 Janvier 2023. La Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis a modifié ses exigences en matière d'expérimentation animale Dans le “FDA Modernization Act 2.0.” approuvé le 23 décembre 2022, il est accepté que l'utilisation de Nouvelles Méthodes Alternatives(NMA), pour établir la sécurité et l'efficacité des médicaments, puisse être adoptée à la place de l'expérimentation animale lorsque cela est approprié. Le projet de loi modifie la loi fédérale sur les aliments, les médicaments et les cosmétiques (FFDCA) pour : Substituer le terme "tests non cliniques" à l'actuel "tests précliniques" (y compris les tests sur les animaux), Substituer le terme "animal" aux "tests non cliniques" et, Ajouter une nouvelle section définissant les "essais non cliniques" pour inclure des méthodes d'essai pertinentes pour l'homme, comme les essais sur cellules, les systèmes microphysiologiques (tels que les "Organ-Chips"), ou les modèles "bioprints" ou informatiques. Cette modification conduira certainement à une diminution significative de l'utilisation de modèles animaux avant les études cliniques.
	6 Janvier 2023. L'Académie chinoise d'ingénierie a indiqué sur son site web que 20 de ses membres étaient décédés entre le 15 décembre et le 4 janvier Les nouvelles en provenance des grandes villes suggèrent qu'une proportion considérable de la population a été infectée par le virus SARS-CoV-2. Le nombre d'ingénieurs et de chercheurs chinois de haut niveau qui sont décédés en moins d'un mois est plus élevé que celui qui meurt habituellement en un an, à la suite de la décision du gouvernement de lever les contrôles Covid. Il en va de même pour les artistes ou acteurs célèbres.
	3 Janvier 2023. La Chine envoie les séquences du SARS-CoV-2 à la base de données privée GISAID Les autorités sanitaires chinoises ont décidé de communiquer à la base de données privée GISAID (et non à l'International Database Collaboration, INSDC), certaines des données de séquences qu'elles ont recueillies après l'arrêt de la politique du "zéro COVID". Ces données montrent la présence de plusieurs variants omicron dans le pays. La Chine surveille aussi les eaux usées pour une alerte précoce pour la présence de coronavirus. Cette pratique est suivie par certains pays depuis le début de la pandémie. La "surveillance des eaux usées" - technique pilotée dans des mégapoles comme Pékin et Shenzhen - est apparue pour la première fois dans les directives nationales Covid-19 de la Chine lorsque les autorités centrales ont publié la semaine dernière une nouvelle liste de stratégies de surveillance.
	1 Janvier 2023. Où trouver les séquences génomiques du SARS-CoV-2 en Chine ? La Commission nationale chinoise de la santé (NHC) est en train d'évaluer l'impact exact de la COVID-19 en Chine. La priorité, pour l'instant, est la prévention et le traitement. Le taux exact de mortalité reste pour l'instant inconnu. Le variant le plus sérieux auquel le monde est actuellement confronté est le variant XBB 1.5, qui représente 40 % des nouvelles infections aux États-Unis. Il semble dominer les nouvelles infections en Asie.

Vagues de COVID-19 en 2022

Vaccination 2021