Doctorat, Modélisation probabiliste en biologie évolutive

Muséum National d'Histoire Naturelle, ENS et Collège de France, Paris

Modèles de naissance-mort et coalescent. Evolution de traits le long d'un arbre.

Master de Mathématiques et Applications

Université Pierre et Marie Curie, Paris

Méthodes numériques probabilistes, processus de Markov, calcul stochastique, statistiques.

L3 de Biologie et M1 Ecologie, Biodiversité, Evolution

ENS, Paris

Génétique des populations, évolution moléculaire, mathématiques pour la modélisation.

\'Ecole Normale Supérieure (ENS)

, Paris

Reçu sur concours pour 4 ans de scolarité.

Classe préparatoire

Lycée Henri 4, Paris

Sciences de la vie, géologie, chimie, physique, mathématiques.

Statisticien - Statistiques appliquées aux essais cliniques

Centre Hospitalo-Universitaire Grenoble Alpes (CHUGA), Grenoble, France

Statistiques, analyse de données et visualisation de données pour les essais cliniques. Enseignement des statistiques à l'hôpitali et à l'université.

Freelance data scientist - Statistiques et enseignement

Grenoble, France

Data science pour l'industrie et l'académique (incluant l'OMS) et enseignement en statistiques.

Post-doctorat - Statistiques en épidémiologie

ETH Zürich, Bâle, Suisse

Au sein du groupe de Tanja Stadler.
Modélisation probabiliste pour l'étude d'épidémies à partir de séquences génétiques virales.

Doctorat - Modélisation mathématique de l'évolution du vivant.

École Normale Supérieure and Collège de France, Paris

Dirigé par Hélène Morlon et Amaury Lambert.
Dévelopemment de modèles probabilistes pour l'étude de l'évolution du vivant sur de longues échelles temporelles.

Stage (année sabbatique) - Terrain en écologie

Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Nouméa, Nouvelle-Calédonie

Sous la supervision d'Hervé Jourdan.
Etude de l'impact d'espèces invasives sur l'herpétofaune endémique de Nouvelle-Calédonie.

Stage de Master (M2) - Modélisation mathématique de la recombinaison

École des Ponts ParisTech, Paris

Sous la supervision de Jean-François Delmas.
Prise en compte de la recombinaison dans les modèles de coalescence en génétique des populations.

Stage de Master (M1) - Modélisation mathématique

Collège de France, Paris

Sous la supervision d'Amaury Lambert et Hélène Morlon.
Modélisation individu-centrée de la diversification.

Statistiques pour la santé

CHUGA, Grenoble, France

Statistiques pour les essais cliniques et l'épidémiologie : concepts de base, modèles linéaires (LM), modèles linéaires généralisés (GLM), modèles à effets mixtes (LMM et GLMM), analyse de survie.

Data Science et visualisation de données

ESTIAM, Lyon, France

Visualisation de données et manipulation de données avec R, tidyverse et ggplot2. Statistiques résumées de tendance centrale, dispersion et données bivariées. Lois de probabilité discrètes et continues classiques. Régression linéaire.

Analyse de séries temporelles

ESTIAM, Lyon, France

Analyse de séries temporelles avec R. Modèle additif ou multiplicatif, tendance, saisonnalité, autocorrélation. Modèles "moving average" (MA) et "auto-regressifs" (RA), ARIMA. Prédiction.

Biologie computationnelle

ETH, Zürich et Bâle, Suisse

Cours de Master de Biologie. Alignement de séquences génétique, modèles d'évolution moléculaire, modèles d'évolution de traits continus, modèles de diversification, méthodes phylogénétiques Bayésiennes.

Séminaire étudiant en biologie computationnelle

ETH, Zürich et Bâle, Suisse

Choice and discussion of relevant papers around the modeling of life evolution.

Informatique, Mathématiques et Statistiques

Université Pierre et Marie Curie, Paris

Introduction à la programmation avec le langage Python pour des étudiants de L2 en biologie. Mathématiques et statistiques pour des étudiants de L3 en biologie. Systèmes dynamiques pour la modélisation en biologie. Tests d'hypothèses utiles pour la biologie.

Interventions en Master: modélisation pour la macroévolution

École Polytechnique et ENS, Paris

Modéliser l'évolution d'un trait le long d'une phylogénie, pour le Master Maths-SV et le Master EBE.

Informatique en classe préparatoire BCPST

Lycée Henri 4, Paris

Initiation à la programmation en Python pour les élèves de première année. Accompagnement de projets d'informatique axés sur la modélisation d'un problème biologique, pour les élèves de deuxième année.

Mathématiques au lycée

Animaths, Paris

Enseignement bénévole pour des élèves de zones d'éducation prioritaire.

Zoé Vaquette

Stage court

Compilation de résultats de génétique des populations pour mieux comprendre l'émergence et la progression de variants du SARS-CoV-2

Antoine Zwaans

Thèse de Master

Reconstruction d'une phylogénie cellulaire en biologie du dévelopement

Remo Bättig

Stage court

Implémentation d'une méthode d'inférence pour un modèle de naissance-mort logistique

Jérémy Andréoletti

Stage longe (M1)

Etude de la diversité des cétacés à partir de données fossiles et actuelles, avec caractères morphologique, moléculaires, ou absence de caractères

Antoine Zwaans

Stage long

Reconstruction de la prévalence d'une épidémie à partir de séquences génétiques virales et de données de comptage