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Ma recherche a pour objet les micro-parasites en général (virus, bactéries et autres micro-eucaryotes pathogènes) et une question centrale : comment la multiplicité des échelles spatio-temporelles, inhérentes à la biologie de ces organismes, façonne-t-elle leur écologie et leur évolution ? Mes travaux reposent sur diverses approches de modélisation articulées autour de trois axes : l'écologie microbienne intra-hôte, la propagation spatiale épidémiologique et l'évolution de traits parasitaires.


► Travaux

publications en tant que principal auteur

Sofonea M. T. (2018) A global asymptotic stability condition for a Lotka-Volterra model with indirect interactions. Applicable Analysis. doi:10.1080/00036811.2018.1437417

Sofonea M. T., Aldakak L., Boullosa L. F. V. V., Alizon S. (2018) Can Ebola Virus evolve to be less virulent in humans? J. Evol. Biol. doi:10.1111/jeb.13229. [pdf][som]

Sofonea M. T., Alizon S., Michalakis Y. (2017) Exposing the diversity of multiple infection patterns. J. Theor. Biol. 419: 278--289. doi:10.1016/j.jtbi.2017.02.011. [pdf][som]

Sofonea M. T., Alizon S., Michalakis Y. (2015) From within-host interactions to epidemiological competition: a general model for multiple infections. Phil. Trans. R. Soc. B. 370(1675): 20140303. doi:10.1098/rstb.2014.030 [pdf][som]

publications en tant que co-auteur

• Gallet R., Fabre F., Thébaud G., Sofonea M. T., Sicard A., Blanc S., Michalakis Y. (2018) Small bottleneck size  in a highly multipartite virus during a complete infectious cycle. J. Virol.  doi:10.1128/JVI.00139-18

pré-publications

Alizon S., Murall C.-L., Saulnier E., Sofonea M. T. (2018) Modelling coinfections to detect within-host interactions from genotype combination prevalences. bioRxiv. doi:10.1101/256586 [pdf]

Sofonea M. T., Alizon S, Michalakis Y. (2018) Why multiple infections favour virulent parasites. bioRxiv. doi:10.1101/258004 [pdf][som]

thèse

Sofonea M. T. (2017) Évolution de la virulence et infections multiples. Thèse de doctorat, sous la direction de Y. Michalakis et de S. Alizon, Université de Montpellier. [pdf]


► Communications internationales

6 exposés sélectionnés, 1 invitation


► Encadrement

Luis F.V.V. Boullosa (M1 international, MEME 2016)
Lafi Aldakak (M1 international MEME, 2015)


► Administration

membre du comité d'organisation du congrès Evolution 2018 (2016 - 2018)
co-organisateur du séminaire hebdomadaire de l'UMR MIVEGEC (2015)